Protein–RNA interactions for Protein: Q3UW22

Defb48, Beta-defensin 42, mousemouse

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defb48Q3UW22 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Defb48Q3UW22 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb48Q3UW22 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb48Q3UW22 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb48Q3UW22 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Defb48Q3UW22 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms