Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQ97

Gm5460, Predicted gene 5460, mousemouse

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5460Q3UQ97 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Gm5460Q3UQ97 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
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Gm5460Q3UQ97 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Gm5460Q3UQ97 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
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