Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
E130208F15RikQ3UPV3 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms