Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Crem-239ENSMUST00000165086 2778 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
D13Ertd608eQ3UPR8 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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