Protein–RNA interactions for Protein: Q3UP24

Nlrc4, NLR family CARD domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,024 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrc4Q3UP24 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Nlrc4Q3UP24 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms