Protein–RNA interactions for Protein: Q3UND0

Skap2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap2Q3UND0 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Skap2Q3UND0 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Skap2Q3UND0 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms