Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMG5

Lrch2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrch2Q3UMG5 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Lrch2Q3UMG5 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms