Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ccdc33Q3ULW6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ccdc33Q3ULW6 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms