Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKP4

Ceacam12, Carcinoembryonic antigen-related cell adhesion molecule 12, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ceacam12Q3UKP4 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ythdf3-203ENSMUST00000191774 3196 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Prkg1-202ENSMUST00000073581 2841 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Neurl1a-201ENSMUST00000111807 3679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Poc1b-204ENSMUST00000159990 3449 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Phactr3-203ENSMUST00000108915 2694 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Mfsd1-201ENSMUST00000029344 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Limk1-201ENSMUST00000015137 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Ceacam12Q3UKP4 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms