Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJV1

Ccdc61, Coiled-coil domain-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc61Q3UJV1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 AC073947.1-201ENSMUST00000216991 649 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Ckb-201ENSMUST00000001304 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Ccdc61Q3UJV1 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Ccdc61Q3UJV1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms