Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB9

Edc4, Enhancer of mRNA-decapping protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edc4Q3UJB9 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm5648-201ENSMUST00000122244 1587 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Med11-202ENSMUST00000151013 445 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Edc4Q3UJB9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Fuz-213ENSMUST00000209039 1453 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Edc4Q3UJB9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms