Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJB0

Sf3b2, Splicing factor 3b, subunit 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b2Q3UJB0 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Lamtor1-201ENSMUST00000033131 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sf3b2Q3UJB0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Adk-201ENSMUST00000045376 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm27622-201ENSMUST00000183779 60 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Sf3b2Q3UJB0 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms