Protein–RNA interactions for Protein: Q3UI66

Ccdc34, Coiled-coil domain-containing protein 34, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc34Q3UI66 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm43356-201ENSMUST00000196582 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tdrd6-203ENSMUST00000168073 7062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc34Q3UI66 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc34Q3UI66 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms