Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHG7

Lchn, Protein LCHN, mousemouse

Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LchnQ3UHG7 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
LchnQ3UHG7 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
LchnQ3UHG7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms