Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGP9

Lrrc58, Leucine-rich repeat-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc58Q3UGP9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Lrrc58Q3UGP9 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms