Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFM5

Nom1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nom1Q3UFM5 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Anxa4-201ENSMUST00000001187 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Nom1Q3UFM5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cd151-202ENSMUST00000106000 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Nom1Q3UFM5 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.2 ms