Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Puf60Q3UEB3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Lrrc24-202ENSMUST00000049956 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Puf60Q3UEB3 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11 ms