Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD01

Atxn7l3b, Ataxin-7-like protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atxn7l3bQ3UD01 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atxn7l3bQ3UD01 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Atxn7l3bQ3UD01 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms