Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3C9

Gse1, Genetic suppressor element 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,213 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gse1Q3U3C9 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Ncf1-201ENSMUST00000016094 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Gse1Q3U3C9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Cdkn1b-201ENSMUST00000003115 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Gse1Q3U3C9 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms