Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1F9

Pag1, Phosphoprotein associated with glycosphingolipid-enriched microdomains 1, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pag1Q3U1F9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Pag1Q3U1F9 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pag1Q3U1F9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms