Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Ccdc174Q3U155 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Ccdc174Q3U155 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms