Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX8

Rufy4, RUN and FYVE domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rufy4Q3TYX8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rufy4Q3TYX8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms