Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYX2

Lrrn4cl, LRRN4 C-terminal-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn4clQ3TYX2 Tpm1-209ENSMUST00000113690 2890 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Phldb1-211ENSMUST00000135436 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Fam71a-201ENSMUST00000171798 2234 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Arhgap11a-204ENSMUST00000110949 4458 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ttyh1-203ENSMUST00000119661 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Lrrn4clQ3TYX2 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Lrrn4clQ3TYX2 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrn4clQ3TYX2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Lrrn4clQ3TYX2 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
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