Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVW5

Tchp, Trichoplein keratin filament-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TchpQ3TVW5 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TchpQ3TVW5 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Myrf-201ENSMUST00000088013 5674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TchpQ3TVW5 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms