Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTL0

Uncharacterized protein C3orf38 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3TTL0 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Q3TTL0 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Q3TTL0 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Q3TTL0 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms