Protein–RNA interactions for Protein: Q3TTD8

Gm21440, Predicted gene, 20737, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21440Q3TTD8 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Maged1-201ENSMUST00000026142 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Gm21440Q3TTD8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Kmt5b-213ENSMUST00000176262 3933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Abl1-201ENSMUST00000028190 5794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Slc25a32-201ENSMUST00000022908 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Gm21440Q3TTD8 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms