Protein–RNA interactions for Protein: Q3TQ03

Ciart, Circadian-associated transcriptional repressor, mousemouse

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CiartQ3TQ03 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
CiartQ3TQ03 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
CiartQ3TQ03 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms