Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP8

Tmem38a, Trimeric intracellular cation channel type A, mousemouse

Predictions only

Length 298 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem38aQ3TMP8 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem38aQ3TMP8 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem38aQ3TMP8 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms