Protein–RNA interactions for Protein: Q3TJD7

Pdlim7, PDZ and LIM domain protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdlim7Q3TJD7 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm13616-201ENSMUST00000120600 222 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Pdlim7Q3TJD7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms