Protein–RNA interactions for Protein: Q3TGW2

Eepd1, Endonuclease/exonuclease/phosphatase family domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eepd1Q3TGW2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Eepd1Q3TGW2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Eepd1Q3TGW2 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms