Protein–RNA interactions for Protein: Q3TBN1

Tmem248, Transmembrane protein 248, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem248Q3TBN1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Tmem248Q3TBN1 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Tmem248Q3TBN1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms