Protein–RNA interactions for Protein: Q3SXD3

Hddc2, HD domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hddc2Q3SXD3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gm45133-201ENSMUST00000207548 2773 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Hddc2Q3SXD3 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Tle1-202ENSMUST00000072695 3644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Hddc2Q3SXD3 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Hddc2Q3SXD3 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms