Protein–RNA interactions for Protein: Q3KNL4

UPF0728 protein C10orf53 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3KNL4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Mapk8ip3-205ENSMUST00000119115 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Q3KNL4 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Q3KNL4 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms