Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
H2-M3Q31093 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms