Protein–RNA interactions for Protein: Q24JP3

Fam178b, Protein FAM178B, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam178bQ24JP3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Fam178bQ24JP3 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Fam178bQ24JP3 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.5 ms