Protein–RNA interactions for Protein: Q1W617

Shroom4, Protein Shroom4, mousemouse

Predictions only

Length 1,475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shroom4Q1W617 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Shroom4Q1W617 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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Shroom4Q1W617 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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Shroom4Q1W617 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
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Shroom4Q1W617 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
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Shroom4Q1W617 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Shroom4Q1W617 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
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