Protein–RNA interactions for Protein: Q1ERP8

Cd300lg, CMRF35-like molecule 9, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd300lgQ1ERP8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cd300lgQ1ERP8 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cd300lgQ1ERP8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms