Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Traf3ip1Q149C2 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
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Traf3ip1Q149C2 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Traf3ip1Q149C2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
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