Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC20.14■□□□□ 0.82
VgfQ0VGU4 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
VgfQ0VGU4 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms