Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGM9

Rtel1, Regulator of telomere elongation helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtel1Q0VGM9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Hpse-201ENSMUST00000045617 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Rbm26-201ENSMUST00000022715 3633 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Rtel1Q0VGM9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Rtel1Q0VGM9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms