Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ewsr1-202ENSMUST00000073308 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Phc2-201ENSMUST00000030588 3949 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ccdc162pQ0VG85 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms