Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF76

Ttc39d, Tetratricopeptide repeat domain 39D, mousemouse

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Length 604 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc39dQ0VF76 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ttc39dQ0VF76 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
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Ttc39dQ0VF76 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
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Ttc39dQ0VF76 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ttc39dQ0VF76 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms