Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF8

Stum, Protein stum homolog, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
StumQ0VBF8 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
StumQ0VBF8 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms