Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Frmd5-213ENSMUST00000212518 922 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ndufb6-201ENSMUST00000095128 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vps8Q0P5W1 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms