Protein–RNA interactions for Protein: Q0KL01

Ubxn2b, UBX domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn2bQ0KL01 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 AC159635.2-201ENSMUST00000223092 817 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Tmem116-202ENSMUST00000060004 1297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC19.39■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gsg1l2-202ENSMUST00000181566 1158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mvk-206ENSMUST00000137167 1049 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm15758-201ENSMUST00000161681 695 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Procr-201ENSMUST00000029140 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Trappc2-203ENSMUST00000116495 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Gm15222-201ENSMUST00000127359 344 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 AC154239.3-201ENSMUST00000226933 674 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Ubxn2bQ0KL01 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms