Protein–RNA interactions for Protein: Q08943

Ssrp1, FACT complex subunit SSRP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssrp1Q08943 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ssrp1Q08943 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms