Protein–RNA interactions for Protein: Q08624

Hoxc4, Homeobox protein Hox-C4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxc4Q08624 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Gstt2-201ENSMUST00000038257 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Hoxc4Q08624 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Hoxc4Q08624 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms