Protein–RNA interactions for Protein: Q08460

Kcnma1, Calcium-activated potassium channel subunit alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnma1Q08460 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Kcnma1Q08460 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Kcnma1Q08460 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms