Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Tff1Q08423 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
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Tff1Q08423 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
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