Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Tgm3Q08189 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms